Isle of Koumi, sebuah pulau indah di Samudra Pasifik. Di pulau itu, orang-orang mewariskan legenda lama turun-temurun bahwa ada Istana Dasar Laut, reruntuhan kuno di dasar laut, di mana harta karun 2 perompak perempuan, Anne Bonnie & Mary Reed (yang benar-benar ada 300 tahun lalu), ditinggalkan. Ketika Conan dan teman-temannya mengunjungi Pulau Koumi saat berlibur, mereka bertemu beberapa pemburu harta karun. Ada sesuatu yang mencurigakan pada mereka.