Dalam waktu dekat, dunia diperintah oleh Smart Brain Corporation, dengan 90% dari populasi menjadi Orphnoch, dan ras manusia yang dulu menonjol hampir punah. Takumi Inui, Kamen Rider Faiz, pernah dianggap sebagai penyelamat umat manusia sampai, dalam serangan oleh pasukan Smart Brain, dia dianggap mati. Sejak itu, kelompok pemberontak manusia telah melakukan serangan terhadap kompleks Smart Brain dalam upaya untuk mencuri Sabuk Kaisar yang sangat rahasia, tanpa hasil. Kiba Yuji, Naoya Kaid dan Yuka Osada berusaha meredakan ketegangan antara kedua ras tetapi pertemuan damai mereka terganggu oleh pasukan Smart Brain dan prajurit terbaru mereka, Kamen Rider Psyga. Takumi, percaya dirinya seorang tukang sepatu muda bernama Takeshi, mendapatkan kembali ingatannya dan menjadi Kamen Rider Faiz lagi untuk menyelesaikan masalah dengan Smart Brain sekali dan untuk selamanya.