Januari 1999: Penyihir magang Azaka Kokutou, adik perempuan Mikiya, telah diperintahkan oleh mentornya, Touko Aozaki, untuk menyelidiki insiden tertentu di mana peri mencuri ingatan siswa di sekolah Azaka, Reien Academy. Azaka meluncurkan penyelidikan dengan bantuan Shiki.