Pada tahun 298 dari era para dewa, anak perempuan sekolah dasar Washio Sumi, Nogi Sonoko, dan Minowa Gin ditugasi dengan misi penting. Mereka menjadi pahlawan dan melawan Vertex, musuh misterius yang menyerang Shinju-sama, pohon dewa yang melindungi Shikoku, satu-satunya wilayah di dunia yang masih layak huni. Apa yang mereka tidak tahu, adalah bahwa pertarungan ini akan merugikan mereka lebih dari yang bisa mereka bayangkan.